CHKBiotech פיתחה בהצלחה ערכת איתור עבור גרסאות וירוס קורונאיות חדשות

זן וריאנטים חדש של וירוס הקורונאבי 501Y-V2 מדרום אפריקה
ב- 18 בדצמבר 2020, דרום אפריקה זיהתה מוטציה 501Y-V2 של נגיף העטרה החדש. כעת המוטציה הדרום אפריקאית התפשטה ליותר מ -20 מדינות. ניסויים הראו כי מעל המוטציות החדשות של נגיף קורונה החדש עשויות לשאת גרסאות אחרות של נגיף קורונה חדש של מוטציות K417N / T, E484K ו- N501Y שיכולות להפחית את יכולת הנטרול של הנוגדנים המנטרלים מפלסמה המופעלים מחיסון. עם זאת, בהשוואה לגנום הייחוס Wuh01 (מספר הרצף MN908947), 501Y.V2 של רצף הגנום המוטנטי הדרום אפריקאי כולל 23 גרסאות נוקלאוטידים. יש לו אותה מוטציה N501Y כמו תת-המוטציה B.1.1.7 בבריטניה, אך עדיין מכילה מוטציות בשני אתרים מרכזיים E484K ו- K417N של חלבון S שיש להם השפעות חשובות על יכולתו של הנגיף להדביק.

נגיף הקורונה החדש הוא נגיף RNA חד-גדילי, אשר מוטציות הגנום שכיחות יותר. איתור יעד יחיד יכול להוביל בקלות לאיתור החמצה של דגימות עם עומס נגיפי נמוך וזני נגיף מוטציה. שיעור הבדיקה מחדש בחיובי היחיד בזיהוי היעד יכול להגיע ליותר מ -10%, מה שעשוי להגדיל את עומס העבודה ולהאריך את זמן האבחון. איתור רב-יעד ואימות הדדי של התוצאות של כל יעד יכולים להגדיל את קצב הגילוי ולהקל על אבחון מוקדם.

news1

איור 1. תרשים סכמטי של מנגנון ההדבקה בווירוס החדש

המוטאנט החדש Coronavirus B.1.1.7 של בריטניה
ב- 26 בדצמבר 2020, המאמר המדעי הראשון של זן B.1.1.7 פורסם ברשת. המכון לאוניברסיטת היגיינה של לונדון ובריטניה ומחלות טרופיות, אישר כי זן B.1.1.7 מסוגל להתפשט יותר מאשר זנים אחרים, שהיו יותר מ -56% (95% CI 50-74%). מכיוון שלמתח המוטציה החדש הזה יש כוח העברה ברור יותר, קשה יותר לשלוט ב- COVID-19. למחרת העלתה אוניברסיטת ברמינגהם בבריטניה מאמר ב- MedRxiv. המחקר מצא שמספר העתקי הגן של נגיף ה- ORF1ab ו- N בחולים שנדבקו בזן המוטציה B.1.1.7 (נשירה של גן S) עלה באופן משמעותי; תופעה זו הייתה במעקב באוכלוסייה. מאמר זה מציין כי לחולים הנגועים במוטציה B.1.1.7 של בריטניה עומס נגיפי גבוה משמעותית, כך שמוטציה זו עשויה גם להיות פתוגנית יותר.

1

איור 2. רצף המוטציה של הגנום הכלול בזן מוטציה של נגיף הכורוס B.1.1.7 של בריטניה

2

איור 3. מוטציה N501Y התרחשה גם בבריטניה וגם בדרום אפריקה וריאנטים

ערכת איתור של גרסאות וירוס חדשות של Coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. פיתחה בהצלחה ערכת זיהוי עבור גרסאות וירוס קורונאיות חדשות B.1.1.7 ו- 501Y-V2.

יתרונותיו של מוצר זה: רגישות גבוהה detection זיהוי סימולטני של 4 מטרות, המכסה את אתרי המוטציה העיקריים של זן מוטציה B.1.1.7 וזן מוטציה דרום אפריקאי 501Y.V2. ערכה זו יכולה לזהות בו זמנית אתרי המוטציה N501Y, HV69-70del, E484K ואת הגן החדש Coronavirus; בדיקה מהירה: לוקח רק שעה 30 דקות מאיסוף הדגימות לתוצאה.

3

איור 4. איתור עקומת ההגברה המשתנה של COVID-19 בבריטניה

4

איור 5. איתור עקומת הגברה של משתנה דרום אפריקאי COVID-19

5

איור 6. סוג פראי של עקומת הגברה חדשה של נגיף הכורוס

לא ברור כיצד מוטציות אלו צוברות השפעה חדשה ארוכת טווח של הימין COVID-19. אך זה מזכיר לנו כי מוטציות אלו עשויות להשפיע על יעילות החסינות הטבעית והחסינות שמקורה בחיסון. זה גם מזכיר לנו שעלינו לעקוב באופן רציף אחר נגיף העטרה החדש במשך זמן רב ולעדכן את חיסון ה- COVID-19 כדי להתמודד עם התפתחותו של נגיף העטרה החדש.


זמן פרסום: מרץ 12-2021